針葉林分佈在海拔2500-3300公尺左右，其中冷杉分佈得比鐵杉、雲杉更高。因林相單純，物種組成也較低海拔少，這裡的樹冠可見一些高山鳥類例如煤山雀、灰頭花翼等，哺乳類如白面鼯鼠，林下的石縫是山椒魚的棲息地，都是非常有特色的動物。鄰近的高山草原、寒原的動物，大多也會利用這片棲地。《玉山國家公園》

位於海拔約2500-3200公尺，海拔高處也就是森林線的所在。優勢樹種例如雲杉、鐵杉，灌木例如玉山杜鵑，底層則多分布玉山箭竹。這裡的生物種類相對於較低海拔雖然不多，但如遇到鳥群則是一片熱鬧，紅頭山雀、青背山雀等跳躍於枝椏，也可見挑戰地心引力、垂直於樹幹上上下下的茶腹鳾。當冬季來臨，因食物來源減少，部分鳥種會降遷到中低海拔。《太魯閣國家公園》

這片霧林帶的生態觀察重點很多，珍稀物種例如觀霧山椒魚、棣慕華鳳仙花等，前者在觀霧山椒魚生態中心，後者在雲霧步道起點都是很好的觀察地點。此外，這裡也是台灣國蝶─寬尾鳳蝶及其食草─台灣檫樹的棲息地，相當珍貴。在天然林中，許多的樹洞和倒木為蝙蝠提供多樣的棲地，蝙蝠種類多達17種；鳥類繁殖季時，各樣鳥種鳴唱不絕於耳，林下漫步著特有種藍腹鷴及帝雉。整體而言，這裡的特有種比例居冠。《雪霸國家公園》

自海拔1000公尺起，就逐漸演變成闊葉林轉為至海拔2500公尺針葉林的針闊葉林混合帶，平地的水氣因海拔上升，溫度降低而凝結，因此針闊葉林盛行雲霧，又稱為雲霧帶或霧林帶。碧綠神木屬於的香杉(巒大杉)就是生長於較上方霧林帶的針葉樹，森林也有雲杉、鐵杉生長著，闊葉樹種則包括台灣紅榨槭、森氏櫟、昆欄樹等。值得一提的是清水山的霧林帶，因屬於石灰岩地質，植被和其他地區不同，其中不乏特稀有植物，例如清水圓柏。霧林帶因森林垂直結構複雜且樹種組成多樣，提供許多棲地及食源給動物，因此這裡的物種豐富度最高。《太魯閣國家公園》

海拔約1500-2500公尺左右，植被以針葉樹如紅檜、二葉松，和樟科、殼斗科為主要組成類群，森林的層次及結構多樣，且有豐富的水氣，也有不少附生植物。這裡涵蓋大多種類的哺乳動物，蝙蝠以許多的無脊椎動物作為食源，白面鼯鼠神秘地滑翔。許多台灣特有鳥種也棲息於此，也是最有機會與千元動物-帝雉相遇的地方。《玉山國家公園》

玉山山區是台灣眾多溪流的分水嶺，其中拉庫拉庫溪的流域包含在園區內，是極為重要的溪流，棲息著保育類－台東間爬岩鰍，還有初級淡水魚如高身鏟頜魚、何氏棘魞，兩者體型都是溪流中的大哥等級。此外也有洄游性的魚蝦，例如日本禿頭鯊、大和米蝦。擁有清澈豐沛溪水的拉庫拉庫溪，是淡水生物珍貴的棲地。《玉山國家公園》

箭竹草原間雜在寒原，其中也會分佈一些針葉樹，在迎風面可見玉山箭竹，背風面可見高山芒，兩者都是水鹿的主要食物，因此這裡有水鹿棲息，此外在碎石坡上還有機會能看到臺灣野山羊跳躍的英姿。箭竹叢中有高山田鼠還有天敵黃鼠狼，比較特別的是棲息在高山的蛇類-菊池氏龜殼花，蝶類如玉山蔭蝶。這裡物種種類雖不多，但各有特色。《玉山國家公園》

玉山的闊葉林幾乎都遭受人為干擾和開發，僅東部園區的瓦拉米至大分區域保留較為完整、原始的闊葉林相。中大型哺乳動物繁多，最著名的應該是大分山區青剛櫟林，是臺灣黑熊的大餐。林下蕨類密集地生長，許多的兩棲爬蟲類在此棲息繁盛，這裡豐富的食物和多樣的棲地，也是許多鳥類、蝙蝠賴以維生的資源。《玉山國家公園》

以樟科及殼斗科植物為主要的闊葉樹種，例如紅楠、杏葉石櫟，雪霸林間步道尤其多有30公尺以上的大喬木。雪霸山區早年伐木、造林活動興盛，這樣天然的闊葉林相當難得，也為動物提供豐富的微棲地與食物。年均溫約攝氏15度，年雨量約3000mm，潮濕溫暖的環境孕育多樣的附生植物，隨處可見碩大的山蘇；多種的蘭科植物，稀有的蕨類如福氏石松，都是珍貴的自然資產。《雪霸國家公園》