針葉林分佈在海拔2500-3300公尺左右，其中冷杉分佈得比鐵杉、雲杉更高。因林相單純，物種組成也較低海拔少，這裡的樹冠可見一些高山鳥類例如煤山雀、灰頭花翼等，哺乳類如白面鼯鼠，林下的石縫是山椒魚的棲息地，都是非常有特色的動物。鄰近的高山草原、寒原的動物，大多也會利用這片棲地。《玉山國家公園》

海拔約1500-2500公尺左右，植被以針葉樹如紅檜、二葉松，和樟科、殼斗科為主要組成類群，森林的層次及結構多樣，且有豐富的水氣，也有不少附生植物。這裡涵蓋大多種類的哺乳動物，蝙蝠以許多的無脊椎動物作為食源，白面鼯鼠神秘地滑翔。許多台灣特有鳥種也棲息於此，也是最有機會與千元動物-帝雉相遇的地方。《玉山國家公園》

玉山山區在海拔約3000公尺以上可見裸岩、岩層破碎帶、低矮草本、箭竹、灌叢等交錯分布的寒原環境，碎石坡有台灣長鬃山羊的身影越過，泥池有水鹿打滾，草生地和岩縫中也生長著許多高山植物，例如玉山卷耳、尼泊爾籟蕭、阿里山龍膽等。這裡也有大片的玉山圓柏純林，由於植株生長及干擾後復原的速度緩慢，是難得的植被景觀。《玉山國家公園》

玉山的闊葉林幾乎都遭受人為干擾和開發，僅東部園區的瓦拉米至大分區域保留較為完整、原始的闊葉林相。中大型哺乳動物繁多，最著名的應該是大分山區青剛櫟林，是臺灣黑熊的大餐。林下蕨類密集地生長，許多的兩棲爬蟲類在此棲息繁盛，這裡豐富的食物和多樣的棲地，也是許多鳥類、蝙蝠賴以維生的資源。《玉山國家公園》